Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbf1A2A870 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbf1A2A870 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbf1A2A870 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbf1A2A870 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbf1A2A870 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbf1A2A870 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbf1A2A870 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbf1A2A870 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbf1A2A870 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbf1A2A870 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms