Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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Rnf19bA2A7Q9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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Rnf19bA2A7Q9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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Rnf19bA2A7Q9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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Rnf19bA2A7Q9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf19bA2A7Q9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
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Rnf19bA2A7Q9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Rnf19bA2A7Q9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf19bA2A7Q9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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Rnf19bA2A7Q9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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Rnf19bA2A7Q9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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Rnf19bA2A7Q9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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Rnf19bA2A7Q9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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Rnf19bA2A7Q9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
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Rnf19bA2A7Q9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf19bA2A7Q9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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