Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo47A2A6H3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo47A2A6H3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo47A2A6H3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo47A2A6H3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo47A2A6H3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms