Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Krtap1-3A2A588 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krtap1-3A2A588 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Krtap1-3A2A588 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Krtap1-3A2A588 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms