Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Akap17bA2A3V1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akap17bA2A3V1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akap17bA2A3V1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Akap17bA2A3V1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akap17bA2A3V1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms