Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RNP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RNP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0U1RNP2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0U1RNP2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms