Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4921501E09RikA0A0R4J054 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms