Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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