Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema4fQ9Z123 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms