Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms