Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rasgef1cQ9D300 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1cQ9D300 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rasgef1cQ9D300 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1cQ9D300 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rasgef1cQ9D300 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rasgef1cQ9D300 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1cQ9D300 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1cQ9D300 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1cQ9D300 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rasgef1cQ9D300 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1cQ9D300 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1cQ9D300 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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