Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nde1Q9CZA6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nde1Q9CZA6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nde1Q9CZA6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nde1Q9CZA6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nde1Q9CZA6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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