Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms