Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MINDY3Q9CV28 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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