Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTRA1Q92743 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTRA1Q92743 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms