Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCQ7RTU9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCQ7RTU9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms