Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q66JV7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q66JV7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q66JV7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q66JV7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q66JV7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q66JV7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q66JV7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q66JV7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q66JV7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms