Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms