Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnga4Q3UW12 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms