Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ssbp4Q3U4B1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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