Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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