Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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