Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms