Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Apoa1Q00623 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms