Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRXP46100 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRXP46100 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRXP46100 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms