Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp4P35123 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms