Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp3P28862 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms