Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtmaP26350 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtmaP26350 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtmaP26350 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtmaP26350 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtmaP26350 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PtmaP26350 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtmaP26350 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms