Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms