Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssh3Q8K330 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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