Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc28aQ8CEI3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms