Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms