Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cops9Q3U898 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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