Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms