Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms