Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ntf3P20181 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms