Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMG1C9JSJ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMG1C9JSJ3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms