Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rtf1A2AQ19 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Rtf1A2AQ19 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Rtf1A2AQ19 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Rtf1A2AQ19 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Rtf1A2AQ19 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Rtf1A2AQ19 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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Rtf1A2AQ19 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rtf1A2AQ19 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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