Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CtcflA2APF3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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