Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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