Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Nop56Q9D6Z1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Nop56Q9D6Z1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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