Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms