Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Upk1aQ9D132 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upk1aQ9D132 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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