Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN4Q92575 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms