Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ApobrQ8VBT6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms