Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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