Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp2Q3UJK4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms