Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc34Q3UI66 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc34Q3UI66 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms