Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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Fam178bQ24JP3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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Fam178bQ24JP3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Fam178bQ24JP3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Fam178bQ24JP3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Fam178bQ24JP3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Fam178bQ24JP3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Fam178bQ24JP3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam178bQ24JP3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms