Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms